Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn3Q07409 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms