Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff2Q03404 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms