Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apoa1Q00623 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms