Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms