Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms