Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

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Length 946 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkn1P70268 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms