Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd13P70217 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd13P70217 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms