Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms