Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Samsn1P57725 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms