Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc12a1P55014 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms