Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chd1P40201 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Chd1P40201 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chd1P40201 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chd1P40201 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Chd1P40201 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chd1P40201 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chd1P40201 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms