Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vav1P27870 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vav1P27870 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vav1P27870 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vav1P27870 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vav1P27870 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vav1P27870 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms