Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
U2af2P26369 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms