Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sdc1P18828 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sdc1P18828 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms