Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc8P09025 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms