Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P01667 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01667 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01667 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms