Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm2035J3QP87 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm2035J3QP87 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms