Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5160F8VPN3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms