Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Myo5cE9Q1F5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Myo5cE9Q1F5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Myo5cE9Q1F5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Myo5cE9Q1F5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Myo5cE9Q1F5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Myo5cE9Q1F5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myo5cE9Q1F5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
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