Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp26c1B2RXA7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms