Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprsB0V2N1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprsB0V2N1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms