Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ubl3Q9Z2M6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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