Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC4Q9Y296 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms