Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema6cQ9WTM3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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