Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Psmb3Q9R1P1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Psmb3Q9R1P1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms