Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms