Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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CtsmQ9JL96 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CtsmQ9JL96 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms