Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms