Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Ccl20-202ENSMUST00000113437 794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Ccl20-203ENSMUST00000186832 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf225Q9D7D1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms