Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CYI0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms