Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrs1Q9CYH6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrs1Q9CYH6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrs1Q9CYH6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrs1Q9CYH6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrs1Q9CYH6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrs1Q9CYH6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrs1Q9CYH6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrs1Q9CYH6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrs1Q9CYH6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrs1Q9CYH6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrs1Q9CYH6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrs1Q9CYH6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrs1Q9CYH6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrs1Q9CYH6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrs1Q9CYH6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrs1Q9CYH6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrs1Q9CYH6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrs1Q9CYH6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrs1Q9CYH6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrs1Q9CYH6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrs1Q9CYH6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrs1Q9CYH6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrs1Q9CYH6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms