Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SmagpQ99KC7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms