Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf3Q922U1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms