Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ApobrQ8VBT6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ApobrQ8VBT6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms