Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnaaf4Q8R368 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms