Protein–RNA interactions for Protein: Q8C267

Setdb2, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB2, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb2Q8C267 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Setdb2Q8C267 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Setdb2Q8C267 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms