Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo38Q8BMI0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms