Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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