Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17leQ7M764 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp17leQ7M764 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp17leQ7M764 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp17leQ7M764 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp17leQ7M764 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp17leQ7M764 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp17leQ7M764 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp17leQ7M764 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp17leQ7M764 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp17leQ7M764 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp17leQ7M764 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp17leQ7M764 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp17leQ7M764 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp17leQ7M764 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms