Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ssx9Q6XAS3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ssx9Q6XAS3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ssx9Q6XAS3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ssx9Q6XAS3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssx9Q6XAS3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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