Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Msl2Q69ZF8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Msl2Q69ZF8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Msl2Q69ZF8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Msl2Q69ZF8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Msl2Q69ZF8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Msl2Q69ZF8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Msl2Q69ZF8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Msl2Q69ZF8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Msl2Q69ZF8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Msl2Q69ZF8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Msl2Q69ZF8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Msl2Q69ZF8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Msl2Q69ZF8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Msl2Q69ZF8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Msl2Q69ZF8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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