Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrcc1Q69ZB0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrcc1Q69ZB0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrcc1Q69ZB0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrcc1Q69ZB0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrcc1Q69ZB0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrcc1Q69ZB0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrcc1Q69ZB0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrcc1Q69ZB0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrcc1Q69ZB0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrcc1Q69ZB0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrcc1Q69ZB0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrcc1Q69ZB0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms