Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Rbm38Q62176 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Rbm38Q62176 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Rbm38Q62176 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rbm38Q62176 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rbm38Q62176 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rbm38Q62176 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rbm38Q62176 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rbm38Q62176 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rbm38Q62176 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Rbm38Q62176 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rbm38Q62176 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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