Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gm29609Q3UU56 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gm29609Q3UU56 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gm29609Q3UU56 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm29609Q3UU56 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm29609Q3UU56 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm29609Q3UU56 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29609Q3UU56 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gm29609Q3UU56 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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