Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
D13Ertd608eQ3UPR8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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D13Ertd608eQ3UPR8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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D13Ertd608eQ3UPR8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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D13Ertd608eQ3UPR8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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