Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ulk3Q3U3Q1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms