Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3TQQ9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms