Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hddc2Q3SXD3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hddc2Q3SXD3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms