Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gata4Q08369 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms