Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms